2003年5月，某省甲种子公司与乙种子公司签订合同，约定由甲公司为乙公司代为培育玉米种子。因玉米种子的市场价格上涨，甲公司不愿按原合同价履约。2004年初，乙公司将甲公司诉至X市中级人民法院。
在诉讼过程中，两公司因赔偿价格的标准及依据问题争执不下。一方主张适用该省人大1989年制定的《农作物种子管理条例》（简称《条例》），该条例规定有关价格的争议应当适用政府指导价。另一方主张适用全国人大常委会2000年制定的《中华人民共和国种子法》（简称《种子法》），该法律规定有关价格的争议应当适用市场价。
请根据上述材料，运用相关法理学知识，回答下列问题：
（1）A市中级人民法院应以《条例》还是《种子法》作为判决依据？为什么？
（2）根据演绎法律推理，说明A市中级人民法院可能进行的法律推理的基本逻辑。
如果全国人大常委会1997年制定的《中华人民共和国价格法》规定，种子价格的争议应适用政府指导价，则该案又应适用哪部法律？为什么？