某外贸日用化工品厂为增值税一般纳税人，主要生产、销售化妆品和护肤护发品，税务师事务所接受企业委托于2009年7月20日对该企业2009年第二季度应纳的增值税、消费税、城市维护建设税和教育费附加进行审核。
要求：
(1)根据所给资料顺序指出存在的纳税问题。
(2)作出相关调账处理。
(3)正确计算该企业2009第二季度应补缴的增值税、消费税、城建税和教育费附加，并作出相关计提和补缴税款的会计处理。
资料：
(1)4月5日，外购一批原材料，增值税专用发票注明的金额为40000元，增值税6800元；运输发票注明的运费为900元，装卸费为200元，保险费为100元，建设基金为100元，合计1300元。该原材料尚未办理入库手续。企业的账务处理为：
借：材料采购 41209
应交税费——应交增值税(进项税额) 6891
贷：银行存款 48100
(2)4月30日，外购一批材料用于职工食堂建造，增值税专用发票注明的金额为30000元，增值税为5100元，企业账务处理为：
借：应付职工薪酬 30000
应交税费——应交增值税(进项税额) 5100
贷：银行存款 35100
(3)5月2日，节日期间，由于保管员失职，导致库存化妆品被盗，经查账面价值 20000元，耗用外购原材料12000元，领导研究决定，由保管员赔一半，另一半计入营业外支出，企业账务处理为：
借：营业外支出10000
其他应收款10000
贷：库存商品 20000
(4)5月29日，将化妆品和护肤护发品组成套装销售，不含税销售额500000元，其中化妆品销售额占40%，护肤护发品销售额占60%，企业计提消费税及其附加的账务处理为：
借：营业税金及附加 60000
贷：应交税费——应交消费税 60000
(5)6月2日，销售一辆使用过的摩托车，原值15000元，收取价款20800元，企业账务处理为：
借：银行存款 20000
贷：固定资产清理 20000
(6)6月30日，企业收到某化妆品店代销清单一张，注明已售化妆品40箱，护肤护发品40箱，企业账务处理为：
借：应收账款 314000
贷：主营业务收入 268376.07
应交税费——应交增值税(销项税额)45623.93
借：营业税金及附加 50256.41
贷：应交税费——应交消费税 50256.41
说明：①各月生产的同类产品的售价相同。
②取得的票据均按税法规定通过比对或认证。第一季度各月应纳的增值税、消费税，已申报缴纳完毕，“应交税费——应交增值税”账户各月均无余额，且各月销项税额大于进项税额。
③增值税税率17%，化妆品税消费税税率30%。
④化妆品店是企业代销商，双方约定，化妆品每销售1箱化妆品支付手续费100元，每销售1箱护肤护发品支付手续费50元，企业产品的含税售价化妆品为5000元/箱，护肤护发品为3000元/箱。