X公司为主要从事各种农业化肥的生产和销售的上市公司。X公司日常交易采用自动化信息系统(以下简称系统)和手工控制相结合的方式。A注册会计师负责审计X公司2×10年度财务报表。
资料一：A注册会计师在审计工作底稿中记录了所了解的X公司情况及其环境，部分内容摘录如下：
(1) 由于20×9年度生产指标未达到董事会制定的目标，X公司于2×10年2月更换了公司负责生产的副总经理及生产部门的经理。
(2) X公司2×10年6月将闲置不用的一台固定资产低价销售给母公司，固定资产原值10万元，已计提折旧6万元，销售价格为2万元。
(3) X公司主要竞争对手于2×10年末纷纷推出促销活动。为了巩固市场份额，X公司于2×11年元旦开始全面下调了主要产品的建议零售价，不同规格的主要产品降价幅度从5%到20%不等。
(4) 2×10年，由于行业状况发生变化，银行授予X公司的银行信贷限额从2×10年之前的1500万元调减为100万元，X公司销售方式主要采用赊销方式，历年的平均贷款金额为1000万元。
(5) X公司于2×10年7月发现在20×9年6月购入的无形资产(管理用)没有记录，由于涉及金额1000万元，所以在管理层审批前先进行了会计调整，然后管理层于2×10年12月予以批准。
(6) 2×10年初，X公司启用存货信息系统，并计划同时使用原手工控制程序6个月。由于同时运行两个流程对X公司相关部门人员的工作量影响很大，2个月后，X公司决定提前停用原手工流程。
(7) 2×10年末，X公司的当地政府环境管理部门，根据收到的群众投诉和调查结果，可能对X公司做出停业整顿1年的处理。
资料二：A注册会计师在审计工作底稿中记录了所获取的X公司财务数据，部分内容摘录如下：
单位：万元
| 项目 | 2×10年 | 20×9年 |
| 营业收入 | 64750 | 58480 |
| 营业成本 | 55440 | 46730 |
| 存货账面原价 | 8892 | 8723 |
| 减：存货跌价准备 | 370 | 480 |
| 存货账面价值 | 8522 | 8243 |
资料三：A注册会计师在审计工作底稿中记录了所了解的有关存货与仓储循环的控制，部分内容摘录如下：
(1) 仓库管理员甲将原材料领用申请单编号、领用数量、规格等信息输入存货信息系统，经仓储经理乙复核并以电子签名方式确认后，系统自动更新材料明细台账。
(2) 系统每月末根据汇总的产成品销售数量及各产成品的加权平均单位成本自动计算主营业务成本，自动生成结转主营业务成本的会计分录并过入相应的账簿。
(3) 每月末进行存货盘点，仓库管理员根据盘点中发现的毁损、陈旧、过时及残次存货编制不良存货明细表，交采购经理丙和销售经理丁分析该存货的可变现净值，如需要计提存货跌价准备的，由会计主管编制存货价值调整表，并安排相关人员进行账务处理。
资料四：A注册会计师对存货与仓储循环的控制实施测试，并在审计工作底稿中记录了测试情况，部分内容摘录如下：
(1) 在抽样追踪了若干笔原材料领用申请单到材料明细台账的过程中，没有发现差异，但是存在仓储经理请假期间，仍然由仓储经理电子签名确认的业务。
(2) 在抽样追踪2×10年11月10个主要产品的主营业务成本在系统中的结转过程时，注意到有2笔主营业务成本的金额存在手工录入修改痕迹。财务人员解释，由于新系统的相关数据模块运行不够稳定，部分产成品的加权平均单位成本的运算结果有时存在误差，因此采用手工录入方式予以修正，并且只有财务经理有权在系统中录入修正数据。审计检查了相关样本的手工修正后产成品加权平均单位成本，没有发现差异。
(3) 注册会计师利用抽样技术，抽取若干份不良存货明细表，检查是否附有支持性的文件，询问采购和销售经理如何分析存货的可变现净值，检查会计主管是否编写了会计估计变更建议，存货跌价准备计提的账务处理和列报是否恰当。检查过程中没有发现异常。
针对资料三(1)至(3)项，假定不考虑其他条件，逐项判断上述控制在设计上是否存在缺陷。如果存在缺陷，分别予以指出，并简要既明理由，提出改进建议。