某中型防洪工程由政府投资兴建。项目法人委托某招标代理公司代理施工招标。招标代理公司依据有关规定确定该项目采用公开招标方式招标，招标公告在当地政府规定的招标信息网上发布，招标文件中规定：投标担保可采用投标保证金或投标保函方式。评标方法采用经评审的最低投标价法。投标有效期为60天。
项目法人对招标代理公司提出要求：为避免潜在的投标人过多，项目招标公告只在本市日报上发布。
项目施工招标信息发布后，共有9家投标人报名参加投标。项目法人认为报名单位多，为减少评标工作量，要求招标代理公司仅对报名单位的资质条件、业绩进行资格审查。
开标后发生的事件如下：
事件1：A投标人的投标报价为8000万元，为最低报价，经评审推荐为中标候选人。
事件2：B投标人的投标报价为8300万元，在开标后又提交了一份补充说明，提出可以降价5%。
事件3：C投标人投标保函有效期为70天。
事件4：D投标人投标文件的投标函盖有企业及其法定代表人的印章．但没有加盖项目负责人的印章。
事件5：E投标人的投标报价最高，故E投标人在开标后第二天撤回了其投标文件。
问题：
E投标人的投标文件是否有效对其撤回投标文件的行为，项目法人可如何处理