某桥梁工程，其基础采用钻孔桩。该工程的施工任务由甲公司总承包，其中桩基础施工分包给乙公司，建设单位委托丙公司监理，丙公司任命的总监理工程师具有多年桥梁设计工作经验。
施工前甲公司复核了该工程的原始基准点、基准线和测量控制点，并经专业监理工程师审核批准。
该桥1号桥墩桩基础施工完毕后，设计单位发现：整体桩位(桩的中心线)沿桥梁中线偏移，偏移量超出规范允许的偏差。经检查发现，造成桩偏移的原因是桩位施工图尺寸与总平面图尺寸不一致。因此，甲公司向项目监理机构报送了处理方案，要点如下：
(1)补桩；
(2)承台的结构钢筋适当调整，外形尺寸做部分改动。
总监理工程师根据自己多年的桥梁设计工作经验，认为甲公司的处理方案可行，因此予以批准。乙公司随即提出索赔意向通知，并在补桩施工完成后第5天向项目监理机构提交了索赔报告：
(1)要求赔偿整改期间机械、人员的窝工损失；
(2)增加的补桩应予以计量、支付。
理由：
(1)甲公司负责桩位测量放线，乙公司按给定的桩位负责施工，桩体没有质量问题；
(2)桩位施工放线成果已由现场监理工程师签认。
乙公司提出的索赔要求，总监理工程师应如何处理说明理由。