某厂计划拟建一条长途高压输电线路及配电站，通过招标确定该工程由具有施工总承包一级资质的电力建设企业实施总承包，为兑现投标承诺，该公司通过质量策划，编制了施工组织设计和相应的施工方案，并建立了现场质量保证体系，制定了检验试验卡，要求严格执行三检制。其中针对专业工程施工而编制的施工方案，符合正确性、针对性、操作性、适用性和全面性要求，具体包括工程概况、编制依据、施工程序、施工方法（含技术要求和质量标准）、进度计划、资源配置计划、安全技术措施、质量管理措施、施工平面布置等内容。在工程开工前，针对本工程的施工特点，进行了全员质量培训、测工培训、质检员培训，依据工程进度进行特殊工种人员适应性培训，使教育培训覆盖率达到100%。
施工过程中遇到了三方面的问题：一是输电线路沿途穿越稻田和山林，变电站设在市郊支线山地公路旁，施工布点要设置器材临时堆放保管场所，作业人员的临时生活设施，以及山地放炮作业等；二是变压器器身运输用大型平板车必须经过市郊支线公路及一座桥梁，根据该桥梁的设计承载能力，存在超载的情况，但别无他途；三是变压器的二次水冷系统制造厂只供给定型设备，管路等连接部件为半成品，要在施工现场组焊安装。
为做好变压器二次水冷系统的安装，施工单位应怎样与制造厂协调？