背景
某公司新建一办公大楼，框架结构，烧结普通砖填充墙。
基础形式为大放脚基础，施工组织设计原定先采用机械开挖，然后人工清底至设计标高。实际土方开挖过程中，机械开挖由于在夜间施工，导致超挖0.2m深。
主体结构施工过程中，由于钢筋放样员识图错误，钢筋下料尺寸超出模板尺寸，需返工处理，施工单位拟将直径16mm以下的钢筋弯折处调直，然后重新加工制作。
屋面梁施工时，混凝土浇筑过后12d采用所有梁模板均拆除完毕，质量检查员发现部分梁出现比较大的孔洞。施工单位将孔洞冲洗干净后，用与梁浇筑时同等强度的混凝土进行填充捣实，并认真养护。
本工程外立面原设计为涂料饰面，主体结构施工完毕后，业主强行将设计更改为隐框玻璃幕墙。幕墙与主体结构采用后置埋件连接，因为幕墙构造需要，部分后置埋件连接位置在填充墙上。
对于基底超挖部分，应如何处理？