XYZ会计师事务所的A和B注册会计师接受委派，对CDE股份有限公司2005年度会计报表进于；审计。CDE公司尚未采用计算机记账。
(1)A和B注册会计师于2005年11月20日至 30日对公司内部控制制度进行了解和测试，并在相关审计工作底稿中记录了了解和测试的事项，摘要如下：
公司主要生产销售各种品种、规格的饮料。财务科现有人员9人，除两名正副科长外，出纳1人，记明细账2人，管资金、银行托收2人，结算成本2人。该厂销售业务是按照销售合同进行的。当生产车间产品完工后，填制产成品入库单，经验收合格后人产成品库。销售科根据销售合同和产成品入库单填制发货通知单，分别通知仓库发货和运输科办理托运手续。产品发出后，销售科根据仓库签收后转来的发货通知开具发货票，并据以登记产成品明细账，运输科将其与销售发票一并送交财务科，财务科将其与销售合同核对后，开具运杂费清单，通知出纳员办理货款结算，并进行账务处理。
(2)A和B注册会计师审计银行存款时，发现 CDE公司2003年度曾在9家银行开过账户，其中7家银行本年度已结清。A和B注册会计师决定对余下的2家银行发函询证。询证函上的银行存款余额依照银行对账单的存款余额填写。恰好公司出纳到开户行办理结算事宜，为节省时间，注册会计师委托公司出纳将询证函转交银行函证。
要求：
(1)根据上述摘录，假定未描述的其他内部控制不存在缺陷，请指出该公司内部控制在设计与运行方面的缺陷、原因，并提出改进建议。
(2)根据对该公司内部控制的了解和测试，请分别指出上述内部控制缺陷与哪些会计报表项目或科目的何种认定相关。
(3)请指出A和B注册会计师审计银行存款的函证测试程序中存在哪些问题，并说明原因，提出修正建议。