[案例3] 某机电安装施工单位承建某城市的一项大型图书馆机电安装工程。合同造价2400万元，其中主材料费和设备费占65%，工期为8个月。 合同约定： (1)工程用主材料和设备由甲方供货，其价款在当月发生的工程款中抵扣。 (2)甲方向乙方支付预付款是合同价20%，并按起扣点发生月开始按比例在月结算工程款中抵扣。 (3)工程进度款按月结算。 (4)工程竣工验收交付使用后的保修金为合同价3%，竣工结算月一次扣留。 该施工单位选用50t汽车吊将28t/台制冷机组从吊装孔吊入地下地层。在吊装时汽车吊其中两个支脚要支在回填处。 在施工资料检查中，发现1份设计变更记录，其内容是通风空调系统工艺发生变更。但未见到该施工方案的修改或补充文件，在施工日志中记录施工员向施工班组采用会议形式介绍设计变更情况。 问题：(1)该工程预付款的起扣点为多少(2)该工程按合同规定项目全部完成，竣工验收合格后，进行竣工结算时还应考虑哪些费用应抵扣或扣留(3)在吊装制冷机组前，对汽车吊的支腿基础应如何处理(4)项目部收到通风空调系统设计变更后，施工员怎样处理存在的问题