要求：请您作为注册税务师，对企业2009年经营业务进行审核，扼要指出存在的影响纳税调整的问题，并计算应补缴的企业所得税。
资料：成都市区某物流公司，2006年1月成立，注册资本5000万元。企业全体职工人数计100人。2009年度相关生产经营业务如下：
(1)当年公路运输收入700万元，全年出租仓库收入80万元，对外打字复印收入20万元。国债利息收入10万元、取得对境内非上市公司的投资收益46.8万元。
(2)为运输收入发生汽车维修费、汽油费，均取得增值税专用发票，专用发票上注明的金额为 250万元。
年初购入打印纸取得普通发票，发票上注明的5万元，当年全部使用。
仓库原值为500万元，为股东投入的固定资产，经企业预计的残值率为10%。为2009年出租，企业于2008年对仓库进行大修理发生支出280万元计入长期待摊费用，预计能延长使用寿命7年(与税务机关认定的摊销年限相同)，上述大修理于2008年12月完工。
(3)全年发生财务费用50万元，其中包含当年3月主管税务机关对其2007年企业所得税纳税检查时，依法征收的税款滞纳金10万元。
(4)管理费用共计50万元，其中列支业务招待费支出25万元，企业研究开发费用20万元。管理费用中列支1月购入税控收款机10台的成本3.51万元，购买税控收款机取得普通发票上注明金额35100元，已经经过主管税务机关的审核批准。
(5)销售费用共计40万元中列支广告费、业务宣传费30万元。
(6)营业外支出共计列支通过青少年基金发展会向农村义务教育捐款10万，税收罚款支出20万元。
(7)全年人平均工资1.2万元，经认定为合理支出，已计入相关成本费用中，并实际发放。
(8)上年广告费超支20万元。